Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LTV1Q96GA3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LTV1Q96GA3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LTV1Q96GA3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms