Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC10A4Q96EP9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC10A4Q96EP9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms