Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RMI2Q96E14 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RMI2Q96E14 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms