Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUB2Q96DC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTUB2Q96DC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTUB2Q96DC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms