Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAF2Q96CS3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAF2Q96CS3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms