Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIFAQ96CG3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIFAQ96CG3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIFAQ96CG3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms