Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RNF34Q969K3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms