Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NEO1Q92859 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NEO1Q92859 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEO1Q92859 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEO1Q92859 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms