Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCSTNQ92542 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCSTNQ92542 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCSTNQ92542 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms