Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMPDL3AQ92484 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMPDL3AQ92484 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms