Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HERVK_113Q902F9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HERVK_113Q902F9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms