Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CTTNBP2Q8WZ74 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CTTNBP2Q8WZ74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CTTNBP2Q8WZ74 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms