Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDD1Q8TEB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD1Q8TEB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms