Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC110Q8TBZ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC110Q8TBZ0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC110Q8TBZ0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms