Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RIN3Q8TB24 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIN3Q8TB24 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIN3Q8TB24 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms