Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PATJQ8NI35 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PATJQ8NI35 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PATJQ8NI35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms