Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHDC9Q8NEP7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHDC9Q8NEP7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHDC9Q8NEP7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms