Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMEM87AQ8NBN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM87AQ8NBN3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms