Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZIC4Q8N9L1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZIC4Q8N9L1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms