Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSGALNACT2Q8N6G5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms