Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHOT1Q8IXI2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOT1Q8IXI2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms