Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLF2Q8IX21 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF2Q8IX21 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SLF2Q8IX21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF2Q8IX21 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms