Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH9Q86YJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH9Q86YJ5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms