Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALYREFQ86V81 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALYREFQ86V81 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALYREFQ86V81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms