Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA8AQ86V59 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PNMA8AQ86V59 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PNMA8AQ86V59 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms