Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D4Q7Z3S7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.8 ms