Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSX7Q7RTT5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSX7Q7RTT5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms