Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47EQ6ZV65 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM47EQ6ZV65 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM47EQ6ZV65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms