Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHISA6Q6ZSJ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHISA6Q6ZSJ9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms