Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM43Q6ZSC3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM43Q6ZSC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms