Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C9orf47Q6ZRZ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf47Q6ZRZ4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms