Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP26C1Q6V0L0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP26C1Q6V0L0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms