Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNT2Q6UVM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNT2Q6UVM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNT2Q6UVM3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms