Protein–RNA interactions for Protein: Q6QN14

USP17L6P, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L6PQ6QN14 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP17L6PQ6QN14 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP17L6PQ6QN14 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP17L6PQ6QN14 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms