Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PGM2L1Q6PCE3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGM2L1Q6PCE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGM2L1Q6PCE3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms