Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDPF1Q6NVV7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDPF1Q6NVV7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms