Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RAB12Q6IQ22 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB12Q6IQ22 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms