Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LHX8Q68G74 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LHX8Q68G74 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms