Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C9orf57Q5W0N0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C9orf57Q5W0N0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C9orf57Q5W0N0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms