Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SWT1Q5T5J6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWT1Q5T5J6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms