Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUP188Q5SRE5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUP188Q5SRE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUP188Q5SRE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms