Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATAT1Q5SQI0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATAT1Q5SQI0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATAT1Q5SQI0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms