Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DCAF6Q58WW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DCAF6Q58WW2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms