Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZC2HC1CQ53FD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC2HC1CQ53FD0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC2HC1CQ53FD0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms