Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SBK1Q52WX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SBK1Q52WX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SBK1Q52WX2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms