Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LONRF3Q496Y0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LONRF3Q496Y0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LONRF3Q496Y0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms