Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF212Q495C1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF212Q495C1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms