Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRK1Q38SD2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRK1Q38SD2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRK1Q38SD2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms