Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A8Q2Y0W8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A8Q2Y0W8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A8Q2Y0W8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms