Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PFKFB3Q16875 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PFKFB3Q16875 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PFKFB3Q16875 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms